大基因变异文库的构建和鉴定对于理解基因组功能至关重要,但这充满挑战性。
我们利用crispr基因编辑技术,引入一种基于利用CRISPR CAS9蛋白,在酵母中高通量构建和分析DNA文库CAS9蛋白的方法,其效率在酵母中为80~100%,定义遗传改变(缺失、替换和插入),用于建立一个突变体池,以及用于跟踪其适应度的方法。
通过表征DNA解旋酶SGS1,小量覆瓦式删除蛋白质中跨越蛋白质长度的突变体和残留在蛋白质中的一系列的点突变,来验证我们的方法。
此外,我们针对分散在酵母基因组中的315个特征有限的小型开放阅读框(smORF,小于100个氨基酸长度),创建了一个全基因组文库,并评估在不同环境条件下,哪个对生长至关重要。
我们的策略可以用高通量的方式精确地研究基础的生物学问题。
用于工程和表型特征程序化突变池的指南+供体基因组编辑平台。
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参考文献
High-throughput creation and functional profiling of DNA sequence variant libraries using CRISPR–Cas9 in yeast
Xiaoge Guo, Alejandro Chavez, Angela Tung, Yingleong Chan, Christian Kaas, Yi Yin, Ryan Cecchi, Santiago Lopez Garnier, Eric D Kelsic, Max Schubert, James E DiCarlo, James J Collins & George M Church
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