利用CRISPR-CAS9在酵母中高通量构建和分析DNA文库

James E DiCarlo, James J Collins & George M Church
2018-05-23

广州美格生物提供全系列的CRISPR Cas蛋白、恒温扩增试剂、逆转录酶、侧向层析试纸条,用于基因编辑、快速检测。想了解详情,请点击:CRISPR Cas蛋白恒温扩增试剂逆转录酶侧向层析试纸条


大基因变异文库的构建和鉴定对于理解基因组功能至关重要,但这充满挑战性。

我们利用crispr基因编辑技术,引入一种基于利用CRISPR CAS9‍蛋白,在酵母中高通量构建和分析DNA文库CAS9蛋白的方法,其效率在酵母中为80~100%,定义遗传改变(缺失、替换和插入),用于建立一个突变体池,以及用于跟踪其适应度的方法。

通过表征DNA解旋酶SGS1,小量覆瓦式删除蛋白质中跨越蛋白质长度的突变体和残留在蛋白质中的一系列的点突变,来验证我们的方法。

此外,我们针对分散在酵母基因组中的315个特征有限的小型开放阅读框(smORF,小于100个氨基酸长度),创建了一个全基因组文库,并评估在不同环境条件下,哪个对生长至关重要。

我们的策略可以用高通量的方式精确地研究基础的生物学问题。

利用CRISPR-CAS9在酵母中高通量构建和分析DNA文库

用于工程和表型特征程序化突变池的指南+供体基因组编辑平台。


返回首页


参考文献

High-throughput creation and functional profiling of DNA sequence variant libraries using CRISPR–Cas9 in yeast

Xiaoge Guo, Alejandro Chavez, Angela Tung, Yingleong Chan, Christian Kaas, Yi Yin, Ryan Cecchi, Santiago Lopez Garnier, Eric D Kelsic, Max Schubert, James E DiCarlo, James J Collins & George M Church


相关阅读

史上最全!CRISPR/Cas9基因编辑方法总结(一)

史上最全!CRISPR/Cas9基因编辑方法总结(二)

什么是CRISPR?

CRISPR-Cas9基因编辑治疗遗传性视网膜疾病   

CRISPR Cas9基因编辑原理、敲除机制   

利用CRISPR-CAS9在酵母中高通量构建和分析DNA文库   

用RCAS-TVA-CRISPR-Cas9系统编辑体细胞基因组,建立精确的肿瘤模型    

利用CRISPR/Cas9蛋白对面包小麦进行基因组编辑   

CRISPR/Cas9技术防止实验性帕金森综合征   



分享