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全基因组甲基化测序分析WGBS

2017-08-11

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技术简介

　　全基因组甲基化测序（WholeGenome Bisulfite Sequencing，WGBS），广泛应用于细胞分化、组织发育等基础机制研究，以及动植物育种、人类健康与疾病治疗等研究领域。

甲基化是基因表达的主要调控方式之一，研究染色体DNA的甲基化情况是了解基因调控的基础获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据，对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。用标准bisulfite方法处理DNA后，未甲基化的胞嘧啶C会脱氨基形成尿嘧啶U。经过PCR扩增，尿嘧啶U替换为胸腺嘧啶T，而发生甲基化的胞嘧啶C保持不变。我们以新一代高通量测序平台为基础，进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。特定物种的高精确度甲基化修饰模式的分析，必将在表观基因组学研究中具有里程碑式的意义，并为细胞分化、组织发育等基础机制研究，以及动植物育种、人类健康与疾病研究奠定基础。

服务流程：

1. 基因组DNA提取

2. Bisulfite转化

3. 文库富集

4. 高通量测序

5. 生物信息学分析

分析内容及流程：

1. 原始数据

2. 数据预处理、质控

3. 转化效率评估

4. Mapping至参考基因组

5. 甲基化水平计算

6. 差异甲基化位点和区段筛选

7. 差异基因及CpG岛注释

送样要求

DNA样品总量：≥3ug(物种基因组≤1.5GB);

≥6ug(物种基因组≤3GB);

≥7ug(物种基因组≤3.5GB);

项目周期

60个工作日（数据量≤600G）

70个工作日以上（数据量≥600G）

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